Hızlı, ucuz, doğru: Araştırmacılar, koronavirüsü tespit etmek için Nobel Ödüllü CRISPR teknolojisi testlerine umut bağladı

[™ Admin]

Hızlı, ucuz, doğru: Araştırmacılar, koronavirüsü tespit etmek için Nobel Ödüllü CRISPR teknolojisi testlerine umut bağladı

Nobel Ödüllü CRISPR teknolojisi 5 dakikalık COVID-19 testi sunar

Laboratuvarlarda yapılan koronavirüs testleri doğruluk için altın standarttır ve antijen testleri hızlı ve ucuz bir alternatiftir.

Bu gen düzenleme teknolojisi testleri hala geliştiriliyor ve bu yıl Amerika Birleşik Devletleri'nde hava soğudukça ve talep dalgalanmaları nedeniyle hazır olmayacak olsa da, araştırma grupları kısa süre önce bunları cazip bir alternatif olarak tanımlayan bilimsel makaleler yayınladılar, çünkü COVID'de test eksiklikleri devam ediyor -19 pandemi.

CRISPR'deki öncü çalışmaları kimyada bu yılki Nobel Ödülünden pay alan California Üniversitesi Berkeley araştırmacısı Dr. Jennifer Doudna, testin hızlı bir şekilde yapılabileceğini ve laboratuvar gerektirmediğini söyledi.

Doudna, "CRISPR tabanlı teşhislerin yaygın kullanıma ulaşmasından önce gitmemiz gereken yollar var, ancak mevcut salgın sırasında bir etki göreceğimize inanıyorum," dedi. "Bu testleri diğer hedefleri tespit edecek şekilde ayarlamak basit olduğu için, şu anda geliştirmekte olduğumuz platform gelecekteki salgınlarda hızlı teşhis için CRISPR'yi dağıtmak için zemin hazırlıyor."

CRISPR veya düzenli aralıklarla kümelenmiş kısa palindromik tekrarlar, kanser ve orak hücre hastalığı tedavilerinden gelişmiş gıda üretimine kadar geniş bir kullanım alanı için incelenen bir gen düzenleme teknolojisidir.

2016'da Doudna'nın laboratuvarı, teknolojiyi kullanarak RNA'yı tespit etmek için bir yol geliştirdi. Laboratuvarı, bir HIV testi geliştirmek için San Francisco merkezli Gladstone Enstitülerinden Dr. Melanie Ott ile işbirliği yaptı, ancak pandemi vurduğunda araştırmacılar bir koronavirüs testi geliştirmeye odaklandı.

Test, COVID-19'a neden olan koronavirüs SARS-CoV-2'deki RNA dizisini tanır.

12 Ekim tarihli bir yayında, araştırmacılar testin beş dakika içinde sonuç verdiğini ve koronavirüslü hastalardan beş örneği doğru şekilde belirlediğini bildirdi. Araştırmacılar, testin ürettiği sinyalleri tespit etmek için bir cep telefonuyla birlikte kullanıldığında, teknolojinin bir laboratuvar dışında hızlı ve düşük maliyetli bir test sağlayabileceğini söyledi.

Massachusetts Teknoloji Enstitüsü bilim adamları, bir laboratuvar dışında kullanılabilecek CRISPR tabanlı bir testi de geliştiriyorlar. Geçen ay yayınlanan bir New England Journal of Medicine mektubunda, araştırmacılar testin bir Washington Üniversitesi laboratuvarında koronavirüslü 202 ve koronavirüssüz 200 örnek kullanılarak değerlendirildiğini söyledi. Test, pozitif numunelerin% 93,1'ini doğru şekilde tanımladı. Test ayrıca% 98.5 özgülüğe sahipti, bu da nadiren yanlış pozitif bildirdiği anlamına geliyor.

Kurgusal bir Hindistan dedektifinin adını taşıyan kağıt tabanlı bir CRISPR testi olan Feluda, bu ülkenin uyuşturucu düzenleyicileri tarafından ticari lansman için onaylandı. Ancak, Johns Hopkins Üniversitesi'nden alınan verilere göre, Hintli şirketler grubu Tata Group'un testi yalnızca ABD'yi yaklaşık 7,7 milyon vaka ile takip eden Hindistan'da nasıl yerleştirmeyi planladığı belli değil.

Hızlı ve doğru test etme
Johns Hopkins Sağlık Güvenliği Merkezi'nde kıdemli bir akademisyen olan Gigi Gronvall, daha fazla laboratuvarın bu teknolojiyi kullanarak testleri keşfetmesini beklediğini söyledi. Bunu "son derece umut verici" olarak nitelendirdi çünkü insanlar testleri laboratuar dışında kullanabilirler.

Gronvall, "Bu genel olarak testlerde büyük bir zorluktu," dedi. "İnsanların sonuçlarını oldukça hızlı almaları gerekiyor, aksi takdirde günlerine devam ederler ve bulaşıcı olabilirler ve diğer insanlarla teması kesmeyebilirler."

Doudna'nın ortak kurduğu, Güney San Francisco merkezli biyoteknoloji firması Mammoth Biosciences, testini daha da geliştirmek ve laboratuvarlar ve tıbbi sağlayıcıların kullanımına sunmak için çalışıyor. Şirket, çabalarını hızlandırmak için Ulusal Sağlık Enstitüleri hibesi aldı.

Mammoth CEO'su Trevor Martin, şirketin hedefinin hem hızlı hem de doğru bir test yapmak olduğunu söyledi.

"Şu anda şu seçimi yapmalısınız: Basit ve hızlı bir şey mi yoksa en yüksek doğruluğa sahip bir şey mi istiyorsunuz?" Martin söyledi.

En doğru laboratuvar testleri, nazal sürüntü örneğinden az miktarda genetik materyali çoğaltan moleküler tabanlı polimeraz zincir reaksiyonu veya PCR'dir. Laboratuvarlar, kimyasal reaktiflerin ve diğer test materyallerinin periyodik olarak eksik olması nedeniyle çalıştırabilecekleri PCR testlerinin sayısı sınırlıdır. Temmuz ayında, talep laboratuarların testleri gerçekleştirme yeteneğini aştığında, testleri büyük laboratuarlara yönlendirilen tüketiciler, sonuçları rutin olarak bir hafta veya daha uzun süre bekledi.

Koronavirüsün proteinlerini tespit eden antijen testleri 15 dakika içinde sonuç üretebilir ancak laboratuvar testlerinden daha az hassas kabul edilir.

Martin, CRISPR tabanlı testlerin "çok basit, çok hızlı ancak son derece hassas bir teknoloji" sunduğunu söyledi.

Ucuz ve erişilebilir olacak şekilde ölçeklendirme
Teknolojinin ötesinde, test geliştiricileri başka bir sorunu çözmeye çalışıyorlar: Kullanımı kolay ve ucuz bir test tasarlamak.

StopCOVID testini geliştiren Broad Institute'un çekirdek üyesi ve MIT biyokimyacısı Dr. Feng Zhang, ekibinin tek kullanımlık bir kartuşla çalışabilen düşük maliyetli bir cihaz yapmak istediğini söyledi. İşbirliği yapanlar, tüketicilerin kendi burun çubuklarını alarak evde kullanabilecekleri kadar kolay bir test istiyor.

Zhang, "Buradaki zorluk, maliyeti olabildiğince düşük hale getirebilmemiz için üretimi nasıl büyüteceğimizi bulmaktır" dedi.

İş arkadaşlarının testi mümkün olan en kısa sürede piyasaya sürmek için çalıştığını söyledi. Testin bir versiyonu zaten bir Tayland hastanesi tarafından hastaları taramak için kullanılıyor.

Mammoth'tan Martin, geniş kullanım için bir test tasarlamanın "pek çok şeyin tökezlediği yer" olduğunu söyledi.

"Yeni bir teknolojiye sahip olmak gerçekten güzel ama onu ihtiyaç duyulan yerlere götürmeniz gerekiyor," dedi. "Bu, üzerinde gayretle çalıştığımız bir şey."

Minnesota Üniversitesi Moleküler Teşhis Laboratuvarı müdürü Dr. Sophia L. Yohe, test geliştiricilerin çok sayıda teste izin verecek adımları düzenleyip düzenleyemeyeceğinin bilinmediğini söyledi.

College of American Pathologists Personalized Health Care Committee Başkanı Yohe, CRISPR testlerinin bazı eski sürümlerinde örneklerin laboratuar tabanlı PCR testlerine benzer şekilde çıkarılmasını ve amplifiye edilmesini gerektirdiğini söyledi.

"Bir seferde sadece bir test yapabiliyorsanız, sadece 30 dakika sürse bile, birdenbire bin test yapmak uzun zaman alıyor" dedi. "Dolayısıyla, ölçeklenebilirlik, yüksek hacimli testler yapmayı düşünüyorsanız, dikkate alınması gereken bir konu olduğunu düşünüyorum."

Kaynak: USA TODAY