Büyük genetik çalışma, koronavirüsün ABD'deki hızlı yayılmanın ortasında mutasyona uğradığını ve potansiyel olarak evrimleştiğini gösteriyor

[™ Admin]

Büyük genetik çalışma, koronavirüsün ABD'deki hızlı yayılmanın ortasında mutasyona uğradığını ve potansiyel olarak evrimleştiğini gösteriyor

Houston'daki bilim adamları, koronavirüsün 5.000'den fazla genetik sekansının, virüsün sürekli mutasyon birikimini ortaya çıkaran bir çalışmasını yayınladı ve bunlardan biri onu daha bulaşıcı hale getirmiş olabilir.

Ancak yeni rapor, bu mutasyonların virüsü daha ölümcül hale getirdiğini veya klinik sonuçları değiştirdiğini bulamadı. Bilim adamları, tüm virüslerin genetik mutasyonlar biriktirdiğini ve çoğunun önemsiz olduğunu söylüyor.

SARS-CoV-2 gibi koronavirüsler, çoğalırken bir düzeltme mekanizmasına sahip olduklarından, virüsler gittikçe nispeten kararlıdır. Ancak her mutasyon bir zar atışıdır ve her gün on binlerce yeni, doğrulanmış enfeksiyon görmeye devam eden Amerika Birleşik Devletleri'nde bu kadar yaygın olan bulaşma ile virüs, potansiyel olarak sorunlu sonuçlara yol açacak çok sayıda değişim fırsatına sahip olmuştur. Houston Methodist Hastanesi'nden yazar James Musser.

Musser, The Washington Post'a "Bu virüse çok şans verdik" dedi. "Şu anda orada çok büyük bir nüfus var."

Weill Cornell Medicine, Chicago Üniversitesi, Argonne Ulusal Laboratuvarı ve Austin'deki Texas Üniversitesi'nden bilim adamları da çalışmaya katkıda bulundu.

Hakemli olmayan yeni çalışma, Çarşamba günü ön baskı sunucusu MedRxiv'de yayınlandı. Şimdiye kadar Amerika Birleşik Devletleri'nde virüsün genetik dizilerinin en büyük tek kümelenmesi gibi görünüyor. Bu ayın başlarında Birleşik Krallık'taki bilim adamları tarafından daha büyük bir dizi dizisi yayınlandı ve Houston çalışmasında olduğu gibi, virüsün yüzeyindeki "başak proteininin" yapısını değiştiren bir mutasyonun aşırı büyük yayılmayı tetikleyebileceği sonucuna vardı. bu belirli türden.

Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü'nde virolog olan David Morens, yeni çalışmayı gözden geçirdi ve bulguların, virüsün popülasyonda ilerledikçe daha bulaşıcı hale geldiğine dair güçlü olasılığa işaret ettiğini ve bunun " onu kontrol etme yeteneğimiz üzerinde etkileri var. "

Morens, bunun tek bir çalışma olduğunu ve "bunun ne anlama geldiğini aşırı yorumlamak istemediğinizi" belirtti. Ancak Morens Çarşamba günü yaptığı açıklamada, virüsün rastgele mutasyonlarla potansiyel olarak maske takma ve sosyal mesafe gibi müdahalelere yanıt verebileceğini söyledi.

Yönetmen Anthony S. Fauci'nin kıdemli danışmanı Morens, "Maske takmak, ellerimizi yıkamak, tüm bunlar bulaşıcılığa veya bulaşmaya engeldir, ancak virüs daha bulaşıcı hale geldikçe, istatistiksel olarak bu engelleri aşmada daha iyidir" dedi. NIAID.

Morens, bunun aşı formülasyonu için etkileri olduğunu söyledi. İnsanlar, enfeksiyonlar veya bir aşı yoluyla bağışıklık kazandıkça, virüs insan bağışıklık tepkisinden kaçmak için seçici baskı altında olabilir.

Morens, "Henüz bilmesek de, bu koronavirüsün nüfus düzeyinde bağışıklığımız yeterince yükseldiğinde, bu koronavirüsün bağışıklığımızı aşmanın bir yolunu bulması olasılık dahilinde" dedi. "Böyle bir şey olsaydı, griple aynı durumda olurduk. Virüsün peşinden gitmemiz gerekecek ve mutasyon geçirdikçe aşımızla uğraşmamız gerekecek. "

Johns Hopkins Üniversitesi Uygulamalı Fizik Laboratuvarı'nda moleküler biyolog olan Peter Thielen, bilim adamlarının Houston araştırmacıları tarafından belirlenen yeni mutasyonların virüsün "uygunluğunu" değiştirip değiştirmediğini görmek için virüsü incelemeye devam etmeleri gerektiğini söyledi. " Bu mutasyonların bir sonucu olarak -2 bulaşabilirlik gerçekten artmıştır. "

Koronavirüsü inceleyen bir başka bilim adamı, Massachusetts Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde virolog olan Jeremy Luban Çarşamba günü bir e-postada şunları söyledi: "Houston gazetesi, SARS-CoV-2 ile ilgili olarak, uyanık kalmamız gerektiği gerçeğini vurguluyor. ve virüsü mutasyonlara karşı izleme kapasitemizi artırıyoruz. "

Ana hastanesi Houston'ın merkezindeki Texas Tıp Merkezi'nin bir parçası olan ve aynı zamanda şehirdeki hastaneleri de içeren Houston Methodist'te, bilim adamları, virüsün ilk geldiği Mart ayının başından bu yana koronavirüsün 30.000 karakterlik genomunu sıralıyorlar. 7 milyon metropol alanı. Kağıt, 5.085 sekansı belgeliyor.

Araştırma, virüsün Houston mahallelerinde iki dalga halinde yayıldığını, önce daha zengin ve yaşlı bireyleri etkilediğini, ardından ikinci dalgada daha genç insanlara ve daha düşük gelirli mahallelere yayıldığını ve birçok Latin şehir sakinini etkilediğini gösteriyor.

Aynı zamanda, virüs Zip kodunu Zip koduyla yayarken, birçoğu başak proteinini etkileyen mutasyonların bir kataloğunu da derledi. Virüs yüzeyinde kıvrık kurdelelerle süslenmiş bir ağacı andıran bu yapı, virüsün hücrelere girmesini sağlar.

Genetik veriler, virüsün Houston'a pek çok kez, muhtemelen ilk başta hava yolculuğu ile geldiğini gösteriyor. Özellikle, başlangıçta gelen virüslerin yüzde 71'i, bilim adamlarının virüse nasıl yayıldığına dair biyolojik bir avantaj sağlayabileceğinden giderek daha fazla şüphe duydukları, ilk olarak Çin'de ortaya çıkmış gibi görünen şimdi ünlü bir mutasyonla karakterize edildi. Spike proteinini kodlayan genomun bir bölgesinde glisin (G) adı verilen bir amino asidin aspartik asit (D) ile ikame edilmesine atıfta bulunan D614G olarak adlandırılır.

Houston'daki salgının ikinci dalgasında, çalışma bu varyantın yüzde 99,9 yaygınlığa sıçradığını ve salgına hakimiyetini tamamladığını buldu. Araştırmacılar, suşla enfekte olan kişilerin üst solunum yollarında daha yüksek virüs yükü olduğunu buldular, bu da suşun daha etkili bir şekilde yayılmasında potansiyel bir faktör.

Kaliforniya'daki Scripps Araştırma Enstitüsü'nde bir immünolog olan ve yeni araştırmaya dahil olmayan Kristian Andersen, yeni çalışmanın önemini küçümsedi. "Sadece daha önce anlatılanları doğruluyor - G zamanla sıklıkta arttı" dedi. Çalışmanın bulduğu çok sayıdaki diğer mutasyona gelince, "sadece katalogluyorlar, ancak herhangi birinin işlevsel bir ilgisi olup olmadığını bilmiyoruz."

Musser, yorumunun D614G'nin Houston ve diğer alanlarda giderek daha baskın hale geldiğini çünkü insanlar arasında yayılmaya daha iyi adapte olduğunu söyledi. Bilimsel davanın bu konuda kapanmadığını kabul etti.

"Bu bir cinayet davası değil," dedi Musser. "Makul bir şüphenin ötesinde bir şey aramıyoruz. Bu bir hukuk davası ve açıkçası, hepimizi aynı sonuca götürdüğünü düşündüğüm kanıtların üstünlüğü, bu suşta, bu soy ailesinde biyolojik olarak farklı bir şey var. "

Son zamanlarda, Birleşik Krallık'ta koronavirüsün yayılmasına ilişkin 25.000 genoma dayanan daha da geniş çaplı çalışma, virüsün bu varyantının "seçici bir avantajla tutarlı bir şekilde" rakiplerini geride bıraktığına dair kanıtlar buldu.

Genel olarak, bilim adamları, doğal seçilimin, virüsün daha etkili bir şekilde yayılmasına yardımcı olan mutasyonları desteklemesini beklerler - çünkü bu, kendisinin daha fazla kopyasını oluşturmasına izin verir - ancak onu daha öldürücü kılanları değil. Ev sahibinin öldürülmesi veya etkisiz hale getirilmesi genellikle virüsün daha fazla insana yayılmasına yardımcı olmaz.

Çalışma, koronavirüsün insanlara bulaşmasına ve zarar vermesine izin veren en önemli parçası olan başak proteinin fiziksel bir yapı taşını değiştiren 285 ayrı mutasyon bölgesi buldu. Bu sitelerdeki değişikliklerin kırk dokuzu daha önce dünya çapında dizilenen diğer genomlarda görülmemişti.

Çalışma, protein mutasyonlarının bazılarını "endişe verici" olarak nitelendiriyor. Makale, spike proteininin herhangi bir ek evriminin meydana geldiğine dair güçlü bir kanıt sunmasa da, bu tekrarlanan ikamelerin, virüsün vücudumuzla ve bağışıklık sistemimizle etkileşime girdiğinde, yardımcı olacak yeni hileler öğreniyor olabileceğine dair bir ipucu sağladığını öne sürüyor. ev sahibine yanıt verir.

"Bence, başak proteinin belirli bölgelerine etki eden immünolojik seçilimle tutarlı olan oldukça iyi kanıtlar var," dedi Musser.

Virüsteki gerçek mutasyonlar, genomunu hücrelerimize kopyalamaya çalışırken hatalar yaptığı için rastgele gerçekleşir. Ancak her yeni vaka, daha fazla mutasyonun meydana gelme şansı verir ve bu da, D614G'nin görünüşe göre halihazırda olduğu gibi, bu mutasyonlardan birinin virüs için yararlı olma şansını artırır.

Virüsün genetik kodunda halihazırda meydana gelen değişiklikler göz önüne alındığında, Musser’in önemli bir sonucu, virüsün bir sonraki adımda ne yapacağını tahmin edebilmek istiyorsak, onu neredeyse yeterince sıralayamadığımızdır.

Amerika Birleşik Devletleri'ndeki Seattle ve Boston gibi bazı büyük metropol alanları da çok fazla sıralama yapıyor olsa da, ülke bir bütün olarak birçok alanı ve bunun sonucunda birçok potansiyel virüs varyantını kaçırıyor. Houston'da bile çalışma, bilinen koronavirüs vakalarının yalnızca yüzde 10'unun sıralandığını tahmin ediyor.

Musser, "Bunu birden fazla yerde gerçek zamanlı olarak oldukça agresif bir şekilde yapmamız gerektiğini düşünüyorum" dedi. Bunu yapmamamızın utanç verici olduğunu düşünüyorum.

Kaynak: The Washington Post